Peter Vandergoten a obtenu son diplôme de cardiologue en 2002, puis il a acquis son expérience en cardiologie interventionnelle à l'hôpital universitaire d'Anvers, où il a exercé de 2002 à 2004. Depuis lors, il travaille en cardiologie générale et interventionnelle aux Cliniques de l’Europe à Bruxelles (Ste-Élisabeth et St-Michel). Il travaille également en cabinet privé à Overijse et fait partie d'une équipe multidisciplinaire au Centre de santé Berlaymont. Il donne des consultations en anglais, en néerlandais et en français.